Коронавирус

[GDV]

Познавательно.

---

О диагностике инфекции SARS-CoV-2 в США.

В США, в целом, самая сильная вирусология и на биомедицинские исследования расходуется огромные деньги, больше, чем где-либо ещё в мире. Главные «действующие лица» этой истории два крупнейших американских государственных агенства, имеющих непосредственное отношение к здравоохранению – CDC (Сenter for Disease Control and Prevention) и FDA (Food and Drug Administration).

Для тех кто не в курсе, CDC это Центр по контролю и профилактике болезней, прежде всего инфекционных. Его функционал приблизительно такой же как у Роспотребнадзора РФ. CDC это самое мощное агенство такого типа в мире. В их распоряжении много денег, отличные лаборатории, в том числе для работы с опасными микроорганизмами, и высокопрофессиональный научный персонал. Функционал FDA, в медицинской его части, оценивать безопасность и эффективность лекарств, методов лабораторной диагностики и медицинских инструментов (по материалам, предоставляемым их производителями) и разрешать или не разрешать их использование в медицинской практике. Разрешение FDA абсолютно необходимо в США, причем лекарства и т.д. могут применяться только по показаниям, прописанным в разрешении. Авторит FDA очень высок. Многие считают его лучшим в мире в данной области. Всё работает очень неплохо в обычной ситуации. И вот происходит непредвиденное – коронавирусная эпидемия.

В соответствии со своим мандатом CDC начинает действовать. В начале всё идет отлично. Благодаря тому, что китайцы без замедления публикуют геномные данные SARS-CoV-2, в CDC тест система (ОТ-ПЦР) на этот вирус готова ещё до появления в США первого инфицированного. С помощью этого ОТ-ПЦР начинают тестировать подозрительные случаи. К 26 января СDС подтверждает 5 случаев SARS-CoV-2. В США есть много компаний и сотни лабораторий, которые без труда могут сделать OT-ПЦР на SARS-CoV-2, но они не имеют на это права без разрешения FDA. Для CDC такое разрешение в экстренной ситуации не нужно.

Вполне разумно CDC хотят подключить к тестированию референс лаборатории различных штатов. В рамках имеющегося у CDC мандата, это можно сделать обеспечив лаборатории штатов точно такими же диагностическими тест-системами, которые сами используют. 5 февраля CDC отправляет свои наборы в лаборатории штатов. Однако, к 12 февраля выясняется, что часть отправленных наборов (приблизительно половина), дефектны. В них неправильно срабатывает отрицательный контроль (образец РНК заведомо не содержащий вирусной РНК). Почему так - отдельный вопрос, не будем отвлекаться.

В остальном наборы работают нормально, а заменить отрицательный контроль элементарно просто. Тем не менее СDC запрещает использовать эти наборы, т.е. останавливает диагностику на местах приблизительно в половине штатов. Естественно, поток образцов с мест в СDC резко возрастает. Тогда CDC официально обращается в FDA с просьбой разрешить изъять дефектный отрицательный контроль из их наборов и разрешить их использовать. FDA в ответном письме вроде бы не против. И тут полный абзац...

Официальное обращение CDC в FDA автоматически включает новый регламент (он называется “emergency use approval”). А это означает, что CDC теперь не имеет права само разрешить на местах использовать свой же набор с «изъятием». Для того, чтобы это стало возможным нужно новое официальное обращение в FDA и получение от них официального разрешения. К 1 марта эта история ещё не закончилась.

А знаете сколько всего исследовано образцов в США на SARS-CoV-2 за всё время с начала января? 459. Для сравнения: в Китае делается 1,6 миллиона ОТ-ПЦР в неделю, а в России на 27 февраля с помощью ОТ-ПЦР исследовано 33 тысячи образцов. Не верите? Я ничего не придумал. Просто пересказал содержание статьи в авторитетнейшем американском научном журнале Science (doi:10.1126/science.abb5152).

[serj_nv]

4 часа назад, ess сказал:

Для оценки опасности не надо быть врачом, для этого достаточно уметь пользоваться калькулятором
Смотрим данные по китаю - 90 тысяч человек заболело (90 тысяч обратилось за помощью, сколько реально заболевших никто не знает, вот я сейчас болею, может у меня коронавирус, а может обычная ОРВИ, к врачу то я не ходил), 3.1 тысяч умерло. Считаем 3.1/90 = 3.4% смертность. Из умерших 80% были старыми, 75% тяжело болели. Ок, 20% были не старыми. 3.4% * 0.02 = 0.7% смертность.

В теории может быть и оно так,  в реальность же нет, если бы при обычном ежегодном вирусе принимались такие-же серьезные карантинные мероприятия то смертность от гриппа снижалась на несколько порядков.  Т.е. допущение о смертности неверное и  больше похоже на ошибку выжившего.

[ess]

Карантинные мероприятия лишь снижают распространение и влияют лишь на абсолютные числа, но никак не влияют на смертность в %.

[serj_nv]

Не знаю, не знаю - вот китайцам сказали не выходить из дома и они и сидят, в т.ч. группа "риска". Это все равно что сказать что смертность от кишечных инфекций  если кипятить воду не снижается в % среди пожилых. Нужно выиграть время для разработки вакцины/лекарство, а это уже не % , а реальные тысячи людей.

[ess]

52 минуты назад, serj_nv сказал:

Не знаю, не знаю - вот китайцам сказали не выходить из дома и они и сидят, в т.ч. группа "риска".

18 часов назад, ess сказал:

Единственные, кому надо сидеть дома и никуда не соваться, это старые или серьезно больные люди, которые действительно могут умереть от этого вируса.

[serj_nv]

Маленькие дети, беременные женщины и т.д. список можно продолжить до бесконечности

[ess]

Нет никакой информации о смертельной опасности для детей и беременных. Пока что ключевых фактора риска два - возраст и тяжелые заболевания. При этом есть и еще интересная особенность - 85% заболевших никогда не курили.

[serj_nv]

16 минут назад, ess сказал:

Нет никакой информации о смертельной опасности для детей и беременных. Пока что ключевых фактора риска два - возраст и тяжелые заболевания. При этом есть и еще интересная особенность - 85% заболевших никогда не курили.

Вообще в мире много чего непонятного и не исследовано. Вот например - в штатах и Европе успешно ведется борьба с курением. Количество курящих упало в разы, казалось статистика рака легких должна тоже в разы снизиться, а нет, снизилась но не в разы. Второй пример язва желудка, за открытие бактерии взывающей ее получили даже нобелевку , бактерия есть у наверное половины населения РФ, но у 90% носителей симптомов болезни не проявляется вообще. 

[Neznajka]

Какая-то истерия. Ну мутировал вирус, так он это умеет. Летучую мышь слопала змея, ту - человек, рынок, где это непотребство продавалось, закрыли побыстрее. Сильно грустно стало, когда в результате мутации вирус смог поразить человека, а теперь уже и люди его передают. Но ведь коронавирус (а их на минуточку - около 40) - был в 2002 - SARS, когда была вспышка атипичной пневмонии, потом свинячий... У того же SARS смертность-то повыше была, там 10%, если не изменяет память, а у нынешнего красавца че та 3-4. Вакцину ждем, а вирус будет продолжать мутировать, вот уже, якобы, собачки заражаются. А старые и больные - они же от любого вируса могут заболеть. 

Ну и видео 

 

[ess]

1 час назад, serj_nv сказал:

Вообще в мире много чего непонятного и не исследовано. 

Я что-то писал про непонятное или неисследованное ?

[serj_nv]

1 час назад, ess сказал:

Я что-то писал про непонятное или неисследованное ?

Да.

Цитата

Нет никакой информации о смертельной опасности для детей и беременных.

Почему для такой болезни информация только по пожилым? Разработка вируса спонсировалась пенсионными фондами? 

[ess]

22 минуты назад, serj_nv сказал:

Да.

Где ?

22 минуты назад, serj_nv сказал:

Почему для такой болезни информация только по пожилым? Разработка вируса спонсировалась пенсионными фондами? 

Потому, что ни одного младенца или беременной женщины не умерло, ваш К.О.

[buster]

2 часа назад, Neznajka сказал:

Какая-то истерия. Ну мутировал вирус, так он это умеет. Летучую мышь слопала змея, ту - человек, рынок, где это непотребство продавалось, закрыли побыстрее.

Не совсем так. Змея никого не лопала. Она вообще с летучей мышью не пересекается в обычных условиях. Но у летучей мыши и змеи были варианты одного вируса. Каждый мог заразить человека, но без особо серьезных последствий. Так вот Ухань - провинция, где забавлялись экзотическими животными (в пищу понятно). Продавали их на рынке. И вот там-то и встретились два варианта вируса. Между ними произошел генетический обмен. И в результате появился третий - коронавирус.

[GDV]

7 минут назад, buster сказал:

Ухань - провинция, где забавлялись экзотическими животными (в пищу понятно).

Почему понятно? Может и не только :).

[GDV]

3 часа назад, ess сказал:

При этом есть и еще интересная особенность - 85% заболевших никогда не курили

С учетом, что в Китае 50% мужчин курят, это немножко странно.