Этот вопрос уже будет регулировать не чешский закон. Ничто при этом, судя по сайту морского реестра, не мешает зарегистрировать яхту под флагом ЧР.
Но что должно радовать топикстартера - на Jachty-plachetnice, též s pomocným motorem, pro námořní plavbu ставка таможенного сбора 0%. Остается решить лишь вопрос с VAT.