Первая причина - в чистой комнате не только ловят пылинки, но и просто соблюдают более жесткие технологические правила. Очень многие вещи просто запрещены - так снижают уровень ошибок. Нельзя принимать пищу, двигаться со скоростью более 1 м/ сек, иметь косметику на коже и т.д. (это для классов 10 и 100). Избытойное давление в комнате не дает возможности влететь пыли и грязи. Кроме того, в таких комнатах собирают оптические приборы, которые весьма чувствительны к пыли. Опять же, когда собирается оборудование за многие миллионы денег - лучше быть осторожным. И материалы из которых сделаны стены и оборудование комнат - также могут иметь влияние на конечный продукт. Что будет потом - вопрос другой, но пока просто исключают фактор ошибки на Земле.
Вторая причина - ученые решили, что нельзя вносить микроорганизмы с Земли на другие планеты, до полного окончания исследований.