Так, как там написано, есть много несоответствий. Работодатель путает компанию и частное предпринимательство. Если это договор двух фирм, никакого разрешения на работу не требуется. Нет зарплат от работодателя. И, тем более, никакого договора трудоустройства с работодателем и быть не может - предполагаемый контракт двух фирм действителен только на месяц (с правом продления или другим контрактом), а это можно делать как еднател Вашей s.r.o.
Все зависит от рода деятельности, прописанного в лицензии Вашей фирмы.
ВСЯ сумма контракта облагается НДС - "работодатель" обязан платить 20% от стоимости услуг (часовая ставка х количество часов)
"В принципе, банковский счет моему SRO не нужен. Хотелось бы, чтобы оплата по этому договору могла идти наличкой." - это невозможно, ни то, ни другое.
Если хотите, могу представить проект контракта - но только на английском; будет необходим чешский перевод.
Если интересует, пошлите сообщение.