У меня есть прога ATnotes, - записки на рабочем столе: Я записываю туда, или просто запоминаю, на какой странице я остановился (потом просто набираю номер нужной мне страницы).
Все мы разные и привыкли к разным инструментам. К pdf-у склоняюсь ещё и потому, что книгу в .pdf можно прочитать на любом компьютере (если там нет Acrobat Reader(а), то его можно быстро стянуть с интернета), а читалки всякие - они хоть и удобные, но сильно привязаны к вашему компьютеру. Тем более, эти программы часто русифицированы и требуют нужные драйвера, плюс читают тексты только на русском и английском. В txt не запихнёшь картинку, математическую формулу, график, а pdf позволяет это делать легко. Хранения материалов в html я считаю вобще не серьезным
Будь у меня халявный принтер, я бы тоже все печатал, а так оно накладно получается. Нет сомнений, что бумагу читать интереснее и приятнее.