Я думаю, там какие-то  бюрократические закавыки... Не было ли у вашей тети в 90-х несколько загранпаспортов, тогда это практиковалось, и я знаю об одном случае путаницы ...в данных был один, а человек взял с собой другой,  но там шло о въезде-выезде.

Что значит "отказа"? Завление на новый паспорт было принято и вы получили отказ? Или "отказ" означает, что заявление не было принято? Если заявление было принято, но в оформлении нового паспорта было отказано, что написано в отказе? С консульским управлением МИДа по этому вопросу связаться пытались? Если отказано было сотрудником консульства в приёме заявления на новый паспорт, чем это было мотивировано? С Консулом эту ситуацию обсуждали?