Идите сразу к ректору, раз такое происходит. Почитайте что написано в законах, в уставе вуза, на что вы имеете право, на что нет - и идите.
У меня 50% учились на коммерческой основе, 50 на бюджетной. За успеваемость плата снижалась. Отличники тут же переводились на бюджетное, плюс получали повышенную стипендию (порядка 200 баксов).