Сейчас на проверки дается, кажется, 15 дней (если не было допусков). Если ответов нет, то ФМС запускает делопроизводство дальше.
Отказать не имеют права.
Переступая порог консульства, вы уже пребываете... ;-)
Более того, заявление можно отправить электронно в консульский департамент МИДа с указанием места получения паспорта.