О мораваках молчу - не знаю. А в "пражском" нам просто СЛЫШАТСЯ разные звуки, по восточнославянской привычке различать их (точно так же, как в чешских словах мы "слышим" ударение где угодно, а не только на первом слоге).
Сколько я ни видел изданий чешского правописания, от тоненьких школьных справочников до толстенных, на сотни страниц, ВСЕ они НАЧИНАЛИСЬ с того, что в чешском языке буквы i и y обозначают один и тот же звук.