Что-то сомневаюсь. А если такой учёт (двух паспортов сразу) у них просто не предусмотрен? Тогда доказывать свою теоретическую процессуальную правоту дежурному в пограничной будке будет непросто и сильно нервно.
У меня нет сомнений, что внутреннее российское законодательство им совершенно побоку. Другое дело, что они могут учитывать возможность иметь несколько действительных загранпаспортов у иностранцев. А могут и не учитывать. Как на самом деле, не знаю. Вот, собственно, думаю, может, кто ответит, а не будет только теоретизировать, как и я :^)
ЗЫ. Первый раз увидел сразу два загранпаспорта у одного человека (француза) в 1991-м. Он давал паспорт дежурному милиционеру в МИДе, тот выскользнул и упал на пол, француз улыбнулся, театрально махнул на него рукой и полез в карман за вторым :^) И надо было видеть шок милиционера, привыкшего, что и один-то далеко не у всех может быть :^)