Однако, при наличии договора
(он может называться как угодно, хоть Zakazka, хоть ТЗ, суть от этого не меняется),
а мы видим наличие договора, присутствие ценника и факт подписания;
в этом случае правильный ответ - предыдущего оратора, именно так и следует поступить.
К основной и доп. фактурам можно приложить пояснительное письмо (небольшое), на 1.1.2013 изготовить акт сверки, и банально вымогать долг.
Посылать, само собой, допорученым. Фактуры можно и нужно 31го отправить, акт сверки можно и в январе.