Приблизительно с начала 2004г. в Чехии были приняты новые правила правописания иностранных фамилий, в женских фамилиях добавлять -ova стало необязательно, и теперь как фамилия будет написана вами, так ее напишут в матрике.
Я, поменяв в новом паспорте написание латиницей ф.и. с белорусского варианта (просто вспомнить страшно, как я там обзывалась ) на русский, везде и всегда пишусь без -ovova, просто - ova. И все ОК.
Кстати и представляюсь всегда без этих -ovova, и все знакомые чехи меня соответственно называют. Правда, если не знают мужа, то в качестве его фамилии используют какоето-то почти забытое русское имя (то, что остается от моей фамилии без -ova)